El IdAB es un Instituto Mixto (único dentro del área de las Ciencias Agrarias del CSIC) de titularidad compartida entre:
El principal órgano de gobierno del Centro es la Junta del Instituto formada por los siguientes miembros:
Por otra parte existe la figura del Claustro científico compuesto por investigadores de plantilla del Instituto que fue constituido en noviembre de 2004.
Funciones repartidas entre las administraciones de la UPNA y del CSIC.
Dos miembros del Instituto figuran en el Comité de Etica, Experimentación Animal y Bioseguridad de la UPNA.
El Instituto posee una Instalación de Isótopos Radioactivos que presta servicio a toda la Universidad. Dos miembros del Instituto son supervisores de la misma.
Durante el año 2007, se ha puesto en marcha un animalario registrado para el manejo de roedores de experimentación. Este animalario se va a utilizar para procedimientos que no requieran niveles especiales de bioseguridad. En 2008 se podrán llevar a cabo procedimientos con agentes patógenos que sí requieren niveles especiales de bioseguridad (tipo P3)
Recae en la figura de un gerente perteneciente a la plantilla del CSIC, contando además con un responsable administrativo de la Universidad encargado de las funciones de relación con la misma.
Los servicios de vigilancia, informática, jardinería, limpieza y mantenimiento son asumidos a través de los contratos establecidos por la UPNA. Los servicios de electricidad, agua e impuestos también son asumidos por la Universidad.
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